מערכת הנמלים בישראל החלה בתהליך מורכב וחשוב של שינוי מבני עם יציאתה לדרך של הרפורמה בנמלים. הפרטת חברת נמל אילת הושלמה. בתחילת שנת 2013 - חברת פפו ספנות זכתה במכרז להפעלת הנמל. בשנת 2010 בהתאם להסכמי הרפורמה בנמלים, אמור היה להתחיל תהליך הפרטה מדורג של חברות הנמל בחיפה ובאשדוד, בימים אלו מסתיים תהליך הפרטת נמל חיפה על ידי רשות החברות הממשלתיות לקבוצת גדות מסופים ולקבוצת אדאני ההודית. בנמל אשדוד התהליך טרם בוצע.